Une restructuration du CSIRO a été annoncée en février 2005. Ses quatre grands domaines de recherche actuels - 1. agroalimentaire et santé ; 2. environnement et ressources naturelles ; 3. technologies de l'information, manufacture et services et ; 4. minéraux et énergies durables- seront réduits à trois - 1. agroalimentaire ; 2. énergies durables et environnement et ; 3. information, manufacture et minéraux. Le groupe de recherche en nutrition d'Adélaïde qui jusqu'à présent faisait partie de la division des sciences de la santé et de la nutrition (Division of Health Sciences & Nutrition or HS&N) a été rattaché à la "Food Science Australia", une joint venture entre le CSIRO et le gouvernement de l'état du Victoria. Les autres groupes du HS&N (protéines et biologie structurale) se joindront à la division des sciences moléculaires pour constituer une nouvelle division. Les deux divisions de recherche en sciences de l'atmosphère et marines seront fusionnées pour former le CSIRO Marine and Atmospheric Research, doté d'un budget annuel de $90 millions et de plus de 500 employés. Ces changements, qui prendront effet le 1er juillet 2005, s'accompagneront d'un certain nombre de licenciements.
