L'aire de la surface exploitée avec des OGM est passée de 500.000 ha en 2005 à 1,4 million d'hectares en 2006, soit un taux de croissance de 180%, ce qui met l'Afrique du Sud en 8ème position mondiale pour la culture de transgéniques, mais en seconde position derrière l'Inde (192%) pour la croissance.
Ces cultures restent controversées en dépit d'une législation qui les autorise à condition que sécurité alimentaire et environnement soient préservés. Cependant, selon les organisations environnementalistes, la sécurité alimentaire ne serait pas établie parce qu'aucun test n'a été effectué localement.
Dans le cas du maïs, nourriture de base pour une grande partie de la population, aucune indication commerciale ne permet au consommateur de reconnaître une origine transgénique. Or, un million d'hectares sont cultivés avec du maïs transgénique, ce qui représente 44% de la surface cultivée en maïs, alors qu'elle n'était que de 29,3% l'année précédente.