Actuellement, seul un tiers de la canne à sucre sert pour obtenir de l'éthanol. Aussi, de nombreuses recherches sont menées au Brésil pour valoriser les deux tiers restant, la bagasse et la paille, sous forme d'alcool. Ces produits résiduels du cycle de production sont parfois utilisés pour produire de l'électricité mais sont généralement brûlés en pure perte. Ces travaux sont d'autant plus importants qu'une étude en cours envisage de faire passer la production brésilienne d'éthanol de 20 milliards de litre/an à 200 milliards de litres d'ici 20 ans.
L'entreprise Dedini a développé le processus Dedini Hidrolise Rapide (DHR) basé sur l'hydrolise acide. Ce nouveau procédé, en phase de test, permet de doubler les rendements par hectare : aux 6400 litres/ha obtenus aujourd'hui s'ajoutent 5600 litres/ha obtenus par la valorisation de la bagasse et de la paille. Dedini a construit une usine pilote dans la ville de Pirassununga, Etat de São Paulo, avec une capacité de traitement de 2 tonnes/heure de bagasse.
Oxiteno, une des plus grandes entreprises brésiliennes du secteur de la chimie, cherche également à obtenir de l'éthanol à partir de cellulose. Son objectif est la production de produits chimiques utilisés dans les industries chimiques et pharmaceutiques.