L'ensemble du système universitaire turc est placé sous la tutelle de deux organes nationaux : - le Conseil inter-universitaire, composé de tous les recteurs d'universités et d'un professeur par université, est chargé de fixer les normes académiques et les conditions d'obtention des diplômes. - le Conseil de l'enseignement supérieur, connu sous le sigle "YOK", directement rattaché au président de la République, est chargé de proposer au gouvernement et au parlement les budgets devant être accordés aux universités ; il prépare les plans de développement à court et long terme ; il propose au gouvernement la création d'universités, de facultés, d'écoles ou d'instituts, la création de postes d'enseignants ; enfin, les recteurs sont nommés par le chef de l'Etat, à partir d'une liste proposée par le YOK.
Le YOK est constitué de 21 membres nommés pour une période (renouvelable) de 4 ans (7 sont nommés par le conseil inter-universitaire, 7 par le gouvernement et 7 par le président de la république). Son président est directement nommé, parmi ses membres, par le président de la République.
M. Yusuf Ziya Ozcan, 56 ans, professeur de sociologie spécialisé en statistiques à l'Université Technique du Moyen-Orient d'Ankara, a été nommé à la tête du YOK par le Président Gül le 11 décembre 2007.