Le 25 octobre 2009, Bo Barker Jørgensen, du Département de Sciences Biologiques de l'Université d'Aarhus, a reçu le "Deutscher Umweltpreis 2009" (Prix de l'Environnement Allemand 2009).
Ce prix est doté d'une bourse de 500.000 euros. Il s'agit du prix environnemental le plus important d'Europe. Il est attribué tous les ans par la fondation allemande Deutsche Bundesstiftung Umwelt (DBU) et a récompensé trois lauréats cette année. Devant un public de plus de 1000 personnes, le président de la République Fédérale Horst Köhler a remis le prix à Augsburg. La remise de prix était également retransmise à la télévision le soir même. Ce n'est que la troisième fois que ce prix prestigieux est remis à un étranger. Le professeur Jørgensen a reçu ce prix pour ses nombreuses années de recherche sur les cycles océaniques du carbone et du soufre et sur le rôle des océans dans le réchauffement climatique.
Le professeur Jørgensen a soutenu son doctorat en biologie à l'Université d'Aarhus, où il a travaillé comme professeur associé de 1977 à 1987. En 1987, il fut nommé Professeur en Recherche par le Conseil Danois pour la Recherche Indépendante, dans la section Sciences Naturelles. Il a travaillé à partir de 1992 en Allemagne, où il a fondé l'Institut Max Planck pour la Microbiologie Marine, actuellement à la pointe de la recherche internationale dans ce domaine. En 1993, il fut nommé à la chaire de géologie de l'Université de Brême, et professeur honoraire de biologie à l'Université d'Aarhus. Depuis 2007, il s'est investi au Danemark dans sa position de Directeur du tout nouveau Centre pour la Geomicrobiologie de l'Université d'Aarhus.
Un élément récurrent des recherches du professeur Jørgensen est le cycle du méthane dans les fonds marins. De grandes quantités de méthane sont en effet produites dans les fonds marins ; ce méthane est ensuite normalement dégradé en dioxyde de carbone sous l'action de microorganismes dans les fonds anoxiques marins. Ces microorganismes, qui forment ainsi une barrière contre les émissions de méthane des fonds marins, ont été découverts par l'équipe du professeur Jørgensen. Le méthane est un gaz à effet de serre très puissant, qui s'accumule actuellement dans l'atmosphère. Il s'agit principalement de méthane émis par les activités humaines (telles que l'élevage, la riziculture ou encore l'utilisation de carburants fossiles), mais aussi de méthane émis à cause du réchauffement de la planète.
Le professeur Jørgensen coordonne actuellement un projet international étudiant la Mer Baltique comme exemple de mer intérieure entourée d'une grande densité de population, et qui est ainsi chargée en nutriments. En travaillant sur la présence de méthane à l'état gazeux dans les fonds marins de la mer Baltique, les chercheurs tentent d'établir une corrélation entre l'augmentation de la concentration en méthane et l'augmentation de température de la mer Baltique, à laquelle est liée la baisse en oxygène que l'on peut actuellement observer. Ce projet fait partie d'un projet de recherche plus global cherchant à comprendre le cycle du méthane dans les fonds marins.