Pour la première fois, des chercheurs de l'Institut de Recherche en Biomédecine (IRB) et du Barcelona Supercomputing Center (BSC) de Barcelone ont mis en évidence la structure de l'ADN Triplex [1]. Pour cela, ils ont montré que cette structure se conservait en phase gazeuse. Cette découverte et l'arrivée de nouveaux instruments de mesure pourraient assurer le développement des traitements antigéniques.
La mise en évidence de l'ADN Triplex en phase gazeuse
La structure la plus commune de l'ADN est celle en double hélice qui unit deux brins complémentaires. L'ADN Triplex est une forme particulière qui contient trois brins - d'où la notion de triple hélice. La présence de cette structure aussi dénommée ADN-H pourrait influer sur l'expression de certains gènes. Jusqu'à présent, cette structure n'avait jamais été identifiée fidèlement car elle est difficile à isoler en phase aqueuse, c'est à dire lorsqu'elle est dans son environnement classique.
L'équipe du Prof Modesto Orozco a tout d'abord démontré, grâce à d'imposantes simulations numériques réalisées au BSC, que la structure de la macromolécule se conservait en phase gazeuse. Les simulations ont aussi permis d'analyser les résultats de spectroscopie de masse afin d'identifier la structure de l'ADN-H.
Un espoir thérapeutique
En permettant de caractériser la structure de cette molécule, les chercheurs ouvrent de nouvelles possibilités thérapeutiques. L'ADN-H pourrait permettre d'inhiber certains gènes provoquant des maladies, venant ainsi neutraliser les causes directes de leur apparition.
Par ailleurs, le travail réalisé - notamment de simulation - va permettre aux chercheurs de développer de nouvelles techniques innovantes de résolution structurelle basées sur l'utilisation de lasers à rayons X à électrons libres (X-FEL) dont une installation européenne est en construction actuellement en Allemagne. "Si nos calculs sont corrects, les rayonnements à électrons libres peuvent être utilisées pour obtenir des données structurelles en phase gazeuse sur le comportement d'une molécule dans son environnement biologique naturel et il s'agirait d'un outil puissant pour comprendre la structure des macromolécules", a commenté Orozco.
[1] The Structure of Triplex DNA in the Gas Phase, A. Arcella et al,. J.Am.Chem.Soc, 134 [15], pp 6596-6606 (2012), doi: 10.1021/ja209786t - http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja209786t